Фамилия Кенжебеков тюркская по происхождению, и её разумнее всего разбирать, начиная с имени, а не с суффикса. Суффикс -ов здесь поздний, русский, он указывает на то, что фамилия оформлялась в документах уже в XIX-XX веках, когда тюркские имена русифицировали для записи в метрики и паспорта.

Основа фамилии — составное мужское имя Кенжебек. Первая часть, «кенже», в казахском, киргизском, каракалпакском и других тюркских языках означает «младший», «последний ребенок» или «поздний сын». Вторая часть, «бек» (или «бий»), — это титул, обозначающий господина, князя, предводителя. В именах тюркских народов эта часть часто теряла прямой социальный смысл и становилась пожеланием благородства или просто престижным компонентом. Таким образом, имя Кенжебек значит «младший господин» или «последний сын-князь».

Скорее всего, Кенжебеком назвали младшего сына в семье, возможно, родившегося, когда старшие дети уже выросли. В традиционной культуре казахов и киргизов имя-оберег Кенже нередко давали, чтобы уберечь ребенка, — считалось, что младший сын останется возле родителей и не покинет родной очаг. Встречается и другой оттенок: так могли назвать единственного наследника, на которого ложилась забота о родителях в старости.

Географически фамилия Кенжебеков наиболее характерна для Казахстана и Киргизии, реже встречается среди каракалпаков и узбеков. В русском контексте она почти не бытует за пределами диаспоры. Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Кенжебаев, Кенжегалиев, Кенжегулов образованы по той же первой части, но с разными вторыми именами, а Кенжебеков — одна из самых распространенных форм с титульным компонентом.

Единого социального слоя у носителей этой фамилии нет: «бек» в составе имени не гарантирует аристократического происхождения, особенно в XX веке, когда такие имена давали уже вне зависимости от сословия. Скорее всего, предок был простым кочевником или земледельцем, а фамилию зафиксировали при советской паспортизации 1920-1930-х годов.