Фамилия Кенжекеева восходит к древнетюркско-татарскому имени Кенжекей. Оно было образовано от слова «кенже», имеющего значение «богатство, ценность», при помощи уменьшительно-ласкательного аффикса -кай (-кей). Обычно так называли самого младшего ребенка в семье. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Кенжекеевых можно лишь на основании генеалогических исследований.