Фамилия Хандин в своей основе почти наверняка имеет тюркское имя Хан (или Кан). В переводе с тюркских и тюрко-монгольских языков «хан» означает «повелитель», «правитель», «князь». Это был титул, который со временем стал личным именем. В русской среде такие имена давали не столько в честь высокого сана, сколько как пожелание силы и удачи ребенку, а иногда и как прозвище властному человеку.

Суффикс -ин указывает на типичную русскую модель образования фамилий: «чей?» — «Хандин», то есть сын или потомок человека по имени Хан. Формально фамилия означает «принадлежащий Хане» или «из рода Ханы». Аналогичным образом образованы тысячи русских фамилий: Иван — Иванов, но если основа оканчивается на -а или согласный, появляется -ин: Хан — Хандин, Петя — Петин.

Примечательно, что в русских документах XVI–XVII веков встречается прозвище Ханда, которое могло быть производным от того же корня или от глагола «хандырить» (бездельничать, шататься) в некоторых говорах. Однако более правдоподобна версия с тюркским титулом: она подтверждается обилием родственных фамилий — Ханов, Ханин, Ханьков. Фамилия Хандин встречается в основном в Поволжье, на Урале и в Сибири — регионах, где исторически было сильное татарское и башкирское влияние, и где тюркские имена легко входили в русский обиход.

Сословной принадлежности по фамилии не установить: Хандиными могли быть и крестьяне, и служилые люди, и купцы. В XIX веке эта фамилия фиксируется в метрических книгах Пермской и Вятской губерний, что подтверждает её урало-прикамские корни. Таким образом, носитель фамилии Хандин почти наверняка ведет род от человека, носившего имя или прозвище Хан, — скорее всего, вольного или служилого предка, жившего в зоне русско-тюркского пограничья.