Фамилия Ханкан — редкая и нестандартная для русского уха. Её происхождение почти наверняка не славянское, и разбирать её по схеме «основа + суффикс» в рамках русской ономастики не получится. В русском языке нет корня «ханк-», а суффикс -ан не характерен для образования фамилий от русских прозвищ или имён.

Самая вероятная версия — это фамилия финно-угорского или прибалтийско-финского происхождения. В финском языке слово hankala означает «трудный, сложный», а hanka — «развилка, пах» или «упряжь». Фамилия могла образоваться от прозвища по месту жительства (например, у развилки дорог или рек) или по характеру (упрямый, «трудный» человек). В Карелии и Финляндии встречаются фамилии Ханка, Ханканен, Ханки — и Ханкан могла быть их русифицированной формой, особенно если носители жили на территории бывшего Великого княжества Финляндского или в смешанных районах (Ленинградская область, Карелия).

Вторая, менее вероятная версия — тюркская. В тюркских языках «хан» — титул правителя, а «кан» — кровь. Но сочетание «ханкан» в значении «ханская кровь» или «рождённый от хана» — это нестандартная модель для фамилий, скорее для имён или прозвищ. Если бы фамилия была тюркской, мы бы ждали форму Ханканов или Ханкаев, а не Ханкан.

Географически фамилия Ханкан встречается крайне редко. В России она может быть единичной, занесённой переселенцами из Финляндии или Эстонии. В самой Финляндии фамилия Hankaan или Hankala не входит в сотни самых распространённых, но её варианты существуют.

Что касается сословной принадлежности — сказать нечего. Финские крестьяне долго не имели фамилий, а получали их в XIX веке по названиям хуторов или прозвищам. Если предки были финнами или карелами, то скорее всего — крестьяне или рыбаки. Если же фамилия тюркская — могли быть и воинами, и ремесленниками.

Таким образом, фамилия Ханкан — скорее всего, финский или карельский след в русском ономастиконе, редкий и локальный. Её значение — «трудный» или «живущий у развилки», а не «ханская кровь», как могло бы показаться при поверхностном взгляде.