Прозвище Ханюк восходит к диалектному слову «ханюка», которое в старину означало «скряга, скупец, кулак». Согласно этому, можно предположить, что основатель рода Ханюковых был бережливым, нерасточительным человеком. Менее вероятно, что эта фамилия образована от имени Ханя, которое является производной формой еврейского имени Ханан, что значит «(Бог) сжалился». Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Ханюк, со временем получил фамилию Ханюков.