Фамилия Харкина звучит как женская форма, но в основе её лежит мужское имя или прозвище Харка. Это просторечный, народный вариант канонического имени Харитон, которое пришло на Русь вместе с христианством из греческого языка. В переводе с греческого Харитон означает «благодатный», «радостный», «осыпанный милостями». Однако в крестьянской и посадской среде длинные церковные имена часто сокращали и переделывали на свой лад, так и появилось короткое и звучное Харка.

Фамилия образована по самой распространённой в русском языке модели: к основе Харк- добавили притяжательный суффикс -ин, который указывает на принадлежность. То есть Харкина буквально означает «дочь или жена Харки», а изначально — «ребёнок Харки». Такая схема типична для фамилий, возникших в среде простого люда, где имя отца или деда без дополнительных церемоний становилось родовым прозванием.

Скорее всего, основатель рода Харкиных не принадлежал к знати. Фамилии на -ин в массе своей закреплялись за крестьянами, мещанами и служилыми людьми невысокого ранга. Боярские и дворянские роды чаще использовали суффикс -ов/-ев, а вот -ин тяготел к именам, оканчивающимся на -а или -я. Поэтому можно уверенно говорить: предок носителей этой фамилии был человеком из простого сословия, которого в обиходе звали Харкой, а его потомков со временем стали записывать как Харкиных.

Интересно, что имя Харитон в народной среде дало целое гнездо родственных фамилий: Харитонов, Харитонцев, Харитошин, а также Харкин и Харкевич. Фамилия Харкина стоит в этом ряду особняком, сохранив именно ту просторечную форму, которая слышалась в живой речи, а не в церковных святцах. Это делает её ценным свидетельством того, как книжное греческое имя осваивалось русским языком и превращалось в нечто своё, родное и узнаваемое.