Фамилия Харсеева хранит память о личном имени предка, и имя это — Харсей. Так в народе, в просторечии, переделали церковное крестильное имя Харисий. Исходное имя пришло из греческого языка и переводится как «приятный», «милый». В святцах ему соответствует имя Харисим, а в народной традиции оно обрастало формами вроде Харасим, отсюда и наш Харсей.

Святым покровителем этого имени почитается мученик Харасим, и церковь вспоминает его 4 сентября. Имя это в старину не было редкостью среди простых людей: крестили так и детей крестьян, и посадских. Поэтому, когда на Руси начали закрепляться фамилии, потомки человека по имени Харсей получили отчество, которое со временем и стало фамилией — сначала Харсеев, а для женщин — Харсеева.

Суффикс -ев в фамилии указывает на принадлежность: Харсеев буквально значит «сын Харсея», «ребёнок Харсея». Модель образования типична для русских фамилий, сложившихся из отчеств, и говорит о том, что родоначальник жил не позднее XVII–XVIII веков, когда такие формы активно закреплялись. Сословной принадлежности фамилия не выдаёт: имя Харсей носили люди разные, но в документах чаще встречаются крестьяне и мещане, а не дворяне.

Интересно, что фамилия сохранила именно народное, разговорное звучание имени, а не книжное «Харисиев». Это редкий случай, когда форма, закреплённая в фамилии, рассказывает о живой речи предков точнее, чем церковные записи. Так что Харсеева — это не просто фамилия, а слепок того, как звучало имя в повседневном обиходе несколько веков назад.