Основой фамилии Хилиниченко послужило мирское имя Хилиник. Мирское имя Хилиник, скорее всего, образовано от слова «хилина», которое в «Толковом словаре живого великорусского языка» В.И. Даля трактуется как «ненастье, слякоть». Вполне вероятно, что такое имя родители дали ребенку, родившемуся в дождливую погоду. По другой гипотезе, имя Хилиник ведет свое начало от другого значения слова «хилина»: «хворь, болезнь, немочь, недуг». В таком случае это имя могло использоваться в качестве оберега. В данном случае, надеясь иметь сильного и здорового мальчика, родители назвали его Хилиником. Это были притяжательные прилагательные с суффиксами –енко, -о, изначально указывающие на имя главы семейства. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Хилиник, со временем получил фамилию Хилиниченко.