Фамилия Хомова образована от мирского имени Хома — просторечной формы канонического имени Фома. В переводе с арамейского оно означает «близнец», и это одно из древнейших христианских имен, принадлежавшее апостолу, который, согласно Евангелию, усомнился в воскресении Учителя. Отсюда и пошло выражение «Фома неверующий», ставшее нарицательным для недоверчивого человека.

Имя Хома было широко распространено в южнорусских и украинских землях. Именно там форма с окончанием на «-а» была привычной в быту: вспомним хотя бы Хому Брута из гоголевского «Вия». Фамилия же Хомова, как и положено русским фамилиям на «-ов», отвечает на вопрос «чей?» — то есть «дочь или жена Хомы». Так что первыми носительницами фамилии были женщины из семьи, где главу звали Хомой.

Иногда можно встретить версию о том, что суффикс «-ич» в родственных фамилиях вроде Хомич указывает на украинское или белорусское происхождение. Но для самой формы Хомова это несущественно: она сложилась по стандартной модели отчества с притяжательным суффиксом, одинаково понятной и в Великороссии, и в Малороссии. Разница лишь в том, что на севере чаще говорили Фомин, а на юге — Хомов.

Интересно, что имя Хома в народной среде не воспринималось как уменьшительное или пренебрежительное. Это была полноправная обиходная форма, которую давали при крещении наравне с церковным Фомой. Поэтому фамилия Хомова не несет оттенка просторечия или насмешки — она такая же почтенная, как и более распространенная Фомина, просто с другим региональным колоритом.

Если ваши предки носили фамилию Хомова, скорее всего, они происходили из южнорусских губерний или с Украины, где имя Хома звучало естественно и привычно. В архивных документах XIX века эта фамилия встречается среди крестьян, мещан и казачества — то есть людей, чьи имена записывали по живому народному произношению, а не по церковным святцам.