Фамилия Хомулко звучит нарочито по-украински, и это первая подсказка. Суффикс -ко — один из главных маркеров украинской ономастики, он встречается в сотнях фамилий (Шевченко, Бойко, Тарасенко). Однако в отличие от патронимических фамилий вроде Иваненко («сын Ивана»), Хомулко происходит не от имени, а от прозвища.

В основе лежит слово «хомул» или «хомула». В украинских говорах так называли неуклюжего, неповоротливого человека, увальня. В польском языке (chomąto) и белорусском (хамут) это слово означает «хомут» — конскую упряжь. Связь прямая: хомут — вещь громоздкая и неудобная, поэтому прозвище Хомул (или Хомула) давали человеку медлительному, тяжелому на подъем, либо тому, кто постоянно возится с упряжью — крестьянину, конюху, извозчику.

Суффикс -к- в фамилии Хомулко выполняет двойную работу. Он может указывать на уменьшительность («маленький Хомул» — возможно, сын или молодой парень) или просто оформлять прозвище в фамилию по распространенной модели. Встречаются варианты написания через «а» — Хамулко, но исходная форма с «о» более характерна для центральных и восточных областей Украины.

Географически фамилия тяготеет к Черниговщине, Полтавщине и Сумщине — регионам, где суффикс -ко особенно активен. В России она редка и встречается в основном у потомков переселенцев с Украины. Сословной принадлежности у фамилии нет: её носили и казаки, и крестьяне, и мещане — прозвище было бытовым, а не аристократическим.