Фамилия Хомячков образована от мирского имени или прозвища Хомячок, и в этом она не одинока: в старых русских документах встречаются и Хомяки, и Хомяковы. Степан Веселовский в своих исследованиях записал князя Ивана Даниловича Хомяка Пенкова, ярославского боярина 1524 года, Степана Хомяка Бундова (1562 год) и Бориса Хомякова из первой половины XVI века. Так что корень у фамилии древний и уходит в дохристианскую, мирскую традицию именования.

Само имя Хомячок — это уменьшительная форма от названия небольшого полевого зверька, хомяка. Когда родители давали ребенку такое имя, они следовали древнему представлению: природа должна воспринимать младенца как своего, а к нему самому перейдут полезные качества зверька — хозяйственность, запасливость, умение устроить нору. Это типичная логика обережных имен, которые должны были защитить человека и наделить его нужными для жизни свойствами.

Но у имени могла быть и другая, более прозаичная подоплека. Хомячком в народе нередко дразнили соню, того, кто любит подолгу спать. Хомяк — зверек, который в спячке проводит значительную часть года, поэтому прозвище легко прилипало к медлительному или сонливому человеку. Какая из версий верна для конкретного предка, теперь не скажешь, но обе имеют право на существование, и обе укладываются в логику народной ономастики.

Сама фамилия построена по простой и распространенной модели: к основе Хомячок добавили суффикс -ов, который указывал на принадлежность. Первоначально Хомячков означало «сын Хомячка», и лишь потом закрепилось как родовое имя. Суффикс -ов здесь закономерен, потому что основа оканчивается на твердый согласный. Если бы прозвище звучало как Хомяк, мы получили бы фамилию Хомяков, а уменьшительная форма дала именно Хомячковых — с тем же корнем, но с более ласковым, семейным оттенком.