Фамилия Хондогий — редкий случай, когда в основе лежит не славянское, а греческое слово, прошедшее через украинскую или белорусскую языковую среду. В отличие от большинства фамилий на -ий, которые образованы от прилагательных (например, Толстый, Мудрый), здесь суффикс выполняет иную роль. Разберемся по порядку.

Корень фамилии — «хондо-» или «хонд-». Он восходит к греческому «χόνδρος» (хондрос) — «хрящ», «зерно», «крупинка». В греческом это слово многозначно: от анатомического термина до обозначения мелкой крупы. В языке понтийских греков, которые массово переселялись в Причерноморье и на юг Российской империи, «хондрос» могло означать и «крупный помол», и «толщина», и даже «человек крепкого, плотного телосложения». Именно в этой среде и могло возникнуть прозвище Хондогий — как характеристика внешности или, реже, рода занятий (например, торговец крупой).

Суффикс -гий (в украинской и греческой передаче часто -гис, -гиос) указывает на принадлежность или свойство. В украинском языке фамилии на -ий, -ій нередко закрепляли прозвища: Хондогий буквально — «тот, кто хондрый», то есть плотный, коренастый. Аналог — фамилия Хонда, встречающаяся у греков Приазовья.

Есть и альтернативная, менее вероятная версия: связь с тюркским «кондык» — «мера сыпучих тел» или «кожаный мешок». Но греческое происхождение выглядит убедительнее: фамилия встречается в украинских метриках XIX века, а также у потомков греческих переселенцев в Мариупольском уезде.

Социальный состав носителей фамилии Хондогий, судя по данным переписей, — в основном крестьяне и мещане южных губерний (Екатеринославской, Херсонской, Таврической). Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. Это фамилия-прозвище, закрепившаяся за конкретным человеком или родом, а не искусственное образование.

В современной России фамилия встречается крайне редко, в основном на юге и в центральных регионах. Известных исторических деятелей с этой фамилией нет — что неудивительно для прозвища, бытовавшего в среде крестьян и ремесленников.