Фамилия Хотенкова принадлежит к самому распространённому в России типу — образована от мужской формы Хотенков с помощью суффикса -а, указывающего на принадлежность женщине (жене или дочери). В основе лежит мужское прозвище или неканоническое имя Хотенко, а то, в свою очередь, — от древнерусского слова «хотеть» с оттенком «желающий, стремящийся» или «любимый, желанный». В старину именем Хотен нередко нарекали долгожданного, вымоленного ребёнка: отсюда и фамилии Хотенков, Хотенов, Хотян.

Модель образования проста: суффикс -енк- в основе Хотенко — типичный для украинских и южнорусских фамилий уменьшительно-ласкательный формант. Сравните: Иван — Иваненко, Семён — Семененко. В русском варианте к такой основе добавили -ов, получив Хотенков. То есть предок носительницы фамилии мог быть выходцем с территории современной Украины или юга России, где прозвища на -енко были особенно распространены в XVI–XVII веках. В письменных источниках фамилия встречается в курских и орловских метрических книгах XIX века — это подтверждает её привязку к южнорусскому ареалу.

Интересная деталь: в «Ономастиконе» Веселовского упоминается Хотен — старомосковское прозвище с тем же корнем, а в былинном цикле есть богатырь Хотен Блудович. Совпадение имён не случайно: «хотеть» в древнерусском языке означало не только «желать», но и «любить», поэтому Хотен — это «любимый, желанный». Так что в основе фамилии — не ремесло и не место жительства, а личное качество или семейная история: вероятно, предок был долгожданным ребёнком или получил прозвище за настойчивый характер.

Встречаются варианты написания — Хотенкова и Хотенкова (с ударением на второй слог), что характерно для фамилий с суффиксом -енк-. В современной России фамилия редкая, не входит в первую тысячу по частотности, но сохранилась в основном в Центральном Черноземье и на востоке Украины.