Фамилия Ховалкин восходит к глаголу «ховать» - «хоронить, прятать, хранить». Соответственно, прозвище Ховалка мог получить скрытный либо скупой человек. Таким образом, фамилия Ховалкин может указывать на определенные черты характера предка. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Ховалка, со временем получил фамилию Ховалкин.