Фамилия Хованисян — типичный пример армянской фамилии, образованной с помощью патронимического суффикса -ян (в старой орфографии -янц), что означает «принадлежащий к роду» или «сын». Основа здесь — имя Ованес (армянская форма библейского Иоанн, то есть Иван). Буквальное значение: «из рода Ованеса» или «потомок Ованеса».

Стоит обратить внимание на начальное «Х»: в русской передаче армянских фамилий звук [h] часто записывают как «х», хотя в оригинале он произносится мягче, почти как украинское «г» или английское h. То есть в самой Армении фамилия звучала бы как «Ованесян» (или «Ованнисян»), но через русское посредство закрепилось написание с «х». Это не ошибка, а адаптация: так же как Ханжян, Халатян, Худавердян — везде начальное «х» передаёт армянское придыхательное h.

Географически фамилия тяготеет к исторической Западной Армении и районам, где говорили на западноармянском диалекте. В нём имя Ованес произносили с более сильным придыханием, что и дало вариант «Хованес». Многие носители фамилии — потомки выходцев из турецкой Армении (Западной Армении), бежавших на восток после геноцида 1915 года. Поэтому в современной Республике Армения фамилия встречается, но чаще — в диаспоре (в России, Ливане, Сирии, Франции, США).

По модели образования фамилия абсолютно прозрачна: личное имя + суффикс. Никаких прозвищ или профессий за ней не стоит. Предок носителя, судя по всему, был просто человеком по имени Ованес (Иван). Никакой сословной окраски у фамилии нет: её могли носить и крестьяне, и ремесленники, и священники. Единственное, что можно добавить: в армянской традиции фамилии на -янц и -ян стали массово фиксироваться в XIX веке, так что глубже XVIII века корни этой фамилии в документах не проследить — только устная родовая память.