Фамилия Хруничева — женская форма фамилии Хруничев, а та, в свою очередь, образована от прозвища или имени Хрунич. Основа здесь неочевидна на первый взгляд, но если отбросить фамильный суффикс -ев, остаётся корень «хрун-». В русских говорах слово «хрун» имело несколько значений, и самое вероятное из них — «свинья, боров» (в ряде диалектов, особенно южных и западных). Прозвище Хрун могли дать человеку либо за внешнее сходство с животным (полнота, неуклюжесть), либо за особенности поведения — упрямство, нечистоплотность. Менее распространённая версия связывает «хруна» с «хрычом» — стариком, но это более позднее и литературное значение.

Интересно, что фамилия Хруничев (и Хруничева) — довольно редкая по модели. Суффикс -ич- в основе указывает на отчество: Хрунич — это «сын Хруна». Такая форма типична для западнорусских и украинских земель, где патронимы на -ич были распространены шире, чем в центральной России. Затем к основе на -ич добавили великорусский суффикc -ев, что дало типичную «гибридную» фамилию: южное или западнорусское прозвище плюс стандартный русский фамильный формант. Встречается она преимущественно в центральных и южных областях России, а также среди потомков переселенцев.

Фамилия стала широко известна благодаря советскому авиаконструктору и организатору промышленности Михаилу Васильевичу Хруничеву (1901–1961), чьё имя носит Государственный космический научно-производственный центр имени М. В. Хруничева. Однако в бытовом, ономастическом смысле её корни гораздо скромнее и уходят в крестьянскую или мещанскую среду, где прозвище, данное по бытовой черте, закрепилось за родом. Сословного барьера у фамилии не было: Хруничевы могли быть и крепостными, и однодворцами, и горожанами. В дореволюционных метрических книгах она встречается нечасто, что подтверждает её локальный, а не массовый характер.