Фамилия Хухлин — одна из тех, что ставит в тупик при попытке бытовой этимологии. На слух она кажется или грубоватой, или загадочной, но на деле её разбор прозрачен, хотя и неочевиден. Это типичная «патронимическая» фамилия на -ин, образованная от личного имени или прозвища Хухля. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Хухлин, то есть сын или потомок Хухли.

Самая правдоподобная версия связывает основу с диалектным словом «хухля» — в русских говорах так называли неопрятного, неряшливого или хилого, болезненного человека. В словаре Владимира Даля встречается глагол «хухлить» — делать что-то небрежно, кое-как. Прозвище Хухля могли дать человеку за неаккуратность в работе или внешнем виде. Такая модель словообразования (глагол → прозвище → фамилия) типична для русских фамилий, и здесь нет нужды искать экзотические корни.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с древнерусским именем Хухол, которое встречается в берестяных грамотах и новгородских памятниках XII–XIII веков. Имя это, скорее всего, восходит к финно-угорскому «хухка» (сухой, тощий) — через контакты славян с местным населением на севере Руси. Если это так, то Хухлин — не прозвищная, а календарная или мирская фамилия, но доказательств мало, и версия с прозвищем остаётся основной.

Географически фамилия редкая. Основные очаги — северо-западные регионы: Псковская, Новгородская, Ленинградская области, а также Вологодчина. Это хорошо согласуется с диалектным происхождением слова: именно в северных говорах «хухля» и «хухлить» фиксируются чаще всего. Встречаемость фамилии в центральной России и Поволжье — единичная, скорее всего результат миграции XIX–XX веков.

С точки зрения социальной истории, носители фамилии Хухлин в большинстве своём были крестьянами. Прозвище не несло знатного или ремесленного оттенка, а описывало бытовую черту — значит, предки не принадлежали к привилегированным сословиям. В документах XVII–XVIII веков фамилия почти не встречается — это косвенно указывает на её позднее оформление, уже после введения подушной переписи.

В написании фамилия устойчива: вариант «Хухлинов» возможен, но не зафиксирован в современных справочниках. Ошибки при записи редки, хотя в дореволюционных метриках можно встретить «Хухлинъ» с твёрдым знаком на конце — дань орфографии.