Фамилия Кинько звучит как типичная украинская фамилия, и это первое, что бросается в глаза. Её выдает суффикс -ко, очень распространенный на территории Украины и юга России. В ономастике этот суффикс часто указывает на уменьшительную или ласкательную форму, либо на принадлежность: «чей?» — «Кинько». То есть исходная основа — это не полное имя, а прозвище или краткое имя Кинько.

Корень фамилии — «кинь-». Самая очевидная и правдоподобная версия ведет к глаголу «кинуть», «кидать». В славянской среде прозвище Кинько могли дать человеку с быстрой, резкой манерой движений, метателю чего-либо (камней, копий), или же тому, кто занимался бросанием, разбрасыванием — например, в работе с сеном или зерном. Менее вероятна, но возможна связь с личным именем Кинь, которое могло быть сокращением от канонического имени Иоаким (через форму Яким), где «к» и «н» могли возникнуть в диалектной речи.

В словарях украинских фамилий Кинько нередко связывают с прозвищным именем Кинь, а сама фамилия документирована в Черниговской, Полтавской и Харьковской губерниях. Это указывает на левобережную Украину как на основную зону бытования. Социально предки носителя фамилии, скорее всего, были казаками или крестьянами, так как суффикс -ко в этой среде был самым ходовым способом образования фамилий.

Интересная деталь: фамилия Кинько — не единственная в своем гнезде. К ней примыкают однокоренные Кинь, Киньков, а также Киненко. Но именно форма Кинько звучит наиболее архаично и прямо отсылает к прозвищу, а не к отчеству. В отличие от фамилий на -енко, которые массово появились позже, фамилии на -ко могли возникать раньше, в XV-XVII веках.