Фамилия Кинниев — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Если сразу отбросить маловероятное заимствование из английского (фамилия Kenny или Kinney), то ключ к разгадке лежит в русском суффиксе -ев и тюркской основе. Фамилия образована по модели отчества: Кинний + -ев, то есть «сын Кинния». Но откуда взялось само имя или прозвище Кинний?

Самая правдоподобная версия — это русифицированная форма тюркского имени Кинья (Киня). У башкир и татар распространено имя Кинйә (Кинья), которое восходит к арабскому «кинйа» — прозвище, данное по имени старшего сына (например, Абу-...). В русской среде такие имена часто адаптировали, добавляя окончание -ий: Кинья превращался в Кинний, а от него уже образовывали фамилию Кинниев. Таким образом, предок носителя фамилии мог быть выходцем из тюркской или башкирской среды, крещёным или переселенцем, чьё личное имя привело к появлению на свет отчества.

Вторая, менее вероятная версия, связывает фамилию с диалектным словом «киня» — в некоторых говорах так называли сварливого, бранчливого человека или, наоборот, того, кто «кипит» гневом. Но эта гипотеза слабая, так как суффикс -ий в прозвище (Киня → Киний) встречается редко, чаще образовывали фамилии сразу от основы: Кинин, Киняев. Поэтому тюркское происхождение выглядит убедительнее.

Географически фамилия Кинниев тяготеет к Поволжью и Приуралью, где исторически было сильное татаро-башкирское влияние. Встречается она в единичных случаях, что говорит о её локальном характере и, возможно, о возникновении в одной конкретной семье, а не в целом роде. В дворянских родословных книгах фамилия не значится, что указывает на крестьянское или мещанское происхождение носителей.