Фамилия Кинжеев — редкий случай в русском ономастиконе, и её разбор упирается в неочевидную основу. Первое, что бросается в глаза, — суффикс -ев, типичный для русских фамилий, образованных от основ на мягкий согласный или -й. Но корень «Кинж-» не встречается ни в древнерусских именах, ни в распространённых прозвищах. Здесь почти наверняка лежит тюркское или кавказское заимствование.

Самая вероятная версия связывает фамилию с тюркским словом «кинжа» или «кынжа» — так в ряде тюркских языков (например, в казахском, ногайском, башкирском) называют кинжал. Прозвище Кинжал могли дать воину, оружейнику или человеку с острым, колким характером. В русской среде к основе добавили фамильный суффикс -ев, и получился Кинжеев — то есть «сын Кинжала». Фонетически переход «кынжа» в «кинжа» и затем в «Кинж-» естественен для адаптации тюркских слов в русском языке.

Менее вероятна, но возможна связь с калмыцким «киндж» — так в некоторых говорах обозначали вид мелкого скота или молодого барана. В этом случае прозвище Кинжеев могло указывать на занятие скотоводством или на внешнее сходство (например, кудрявый или невысокий человек). Однако эта версия слабее, так как «киндж» — локальное слово, не зафиксированное в широком употреблении.

Географически фамилия Кинжеев тяготеет к югу России и Поволжью — регионам, где веками шло смешение русского и тюркского населения. Встречается она редко, в основном в Астраханской, Волгоградской областях и в Калмыкии. Это не дворянская фамилия и не купеческая; её носители, скорее всего, происходят из казаков, крестьян или мелких служилых людей, которые переняли тюркское прозвище в быту.

В написании фамилии стоит обратить внимание на букву «е» после «ж»: она указывает на то, что ударение, вероятно, падает на второй слог — Кинжéев. Если бы исходная основа звучала как «кинжа» с ударением на первый слог, фамилия писалась бы через «а» — Кинжаев. Но именно вариант с «е» подтверждает тюркскую огласовку, где гласный в корне был мягким или редуцированным.