Фамилия Кирпиленко образована по одной из самых продуктивных моделей украинской ономастики — с суффиксом -енко. В буквальном смысле это «сын Кирпила» или «потомок Кирпила». Основа фамилии — прозвище или разговорная форма имени Кирпил, которая, в свою очередь, восходит к каноническому имени Кирилл (от греческого «кириос» — господин, владыка). Фонетические изменения — замена «и» на «ы» и упрощение двойного «л» — типичны для южнорусских и украинских говоров, где церковное имя адаптировалось к местному произношению.

Географически фамилия Кирпиленко тяготеет к левобережной Украине и южным регионам России, где исторически была высока плотность фамилий на -енко. Это говорит о том, что предки носителя фамилии, скорее всего, происходили из казацкой или крестьянской среды. В Речи Посполитой и Российской империи фамилии с таким суффиксом не давали дворянам — они оставались маркером простого сословия, где отчество или прозвище отца превращалось в наследственное имя семьи.

Стоит обратить внимание на редкий момент: в отличие от более распространённых Кириленко или Кирилленко, форма Кирпиленко содержит вставное «п». Это может быть следствием диалектного произношения (так называемая эпентеза — появление звука для удобства речи) либо результатом смешения с другим корнем. Например, в народе слово «кирпич» могло повлиять на звучание фамилии, хотя этимологически они не связаны. Версия о связи с ремеслом кирпичника (от слова «кирпич») менее вероятна, так как суффикс -енко указывает на происхождение от личного имени, а не от профессии.

В письменных источниках фамилия встречается с XIX века в метрических книгах Полтавской, Харьковской и Екатеринославской губерний. Написание могло варьироваться: Кирпиленко, Кирпиленко, Кирпиленко — из-за неустойчивости гласных в безударной позиции. В современной России фамилия считается редкой, её носители в основном сосредоточены в Краснодарском крае и Ростовской области, куда переселялись украинские крестьяне в конце XIX — начале XX века.