Фамилия Кисиличина — редкий случай, когда в основе лежит не имя и не профессия, а, скорее всего, прозвище, связанное с птицей. Самая прямая и очевидная версия отсылает к слову «кислица» — так в некоторых русских говорах называли синицу. Прозвище Кисилица (или Киселица, с чередованием согласных) могли дать человеку невысокого роста, юркому, голосистому или, наоборот, суетливому — по аналогии с повадками этой птицы. Суффикс «-ич» в мужской форме (Кисилич) указывает на отчество: «сын Кисилича», то есть сын человека с прозвищем Кисилица. Женская форма Кисиличина — это жена или дочь Кисилича.

Менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с диалектным глаголом «киселить» — делать кислым, квасить. Тогда прозвище могло относиться к человеку, который занимался приготовлением кваса, браги или просто имел пристрастие к кислой пище. Однако эта гипотеза слабее: отглагольные прозвища на «-ица» в русской антропонимии встречаются реже, чем анималистические.

Особенность фамилии — её окончание «-ина». В русской традиции фамилии на «-ин» образуются от основ на «-а» или «-я» (Кисилица → Кисилицын, но здесь основа на мягкий согласный — Кисилич → Кисиличина). Это типичная модель для северных и центральных областей России. В документах XIX века фамилия могла писаться через «е» — Киселичина, что подтверждает связь с диалектным произношением. Сословного барьера у неё не было: носители могли быть и крестьянами, и мещанами, но в дворянских родословных книгах эта фамилия не встречается — слишком прозрачная «птичья» основа для претензий на знатность.

Из-за редкости фамилии точных географических привязок по переписям нет, но корни логичнее всего искать в Поволжье или на Русском Севере — там синицу чаще называли «кислицей», и там же активнее использовалась модель отчества с суффиксом «-ич» в быту, а не только в официальных документах.