Фамилия Кистайкины — один из тех случаев, когда в основе лежит не христианское имя, а местное, дохристианское. Она принадлежит к распространенному типу мордовских фамилий и образована от имени собственного Кистайка. Суффикс -ин в конце указывает на принадлежность: «чей?» — «Кистайкин», то есть сын или потомок Кистайки.

Самое вероятное объяснение корня связано с мокшанским словом «киста» — дорога. Имя Кистайка могли дать младенцу, который родился в пути. Такая практика — называть детей по обстоятельствам рождения — была обычна у многих народов Поволжья до принятия христианства. Не исключено и другое: прозвище Кистайка мог получить человек, живший рядом с дорогой или при дороге.

Есть и версия, уводящая в диалекты. В некоторых говорах бытовал глагол «кистать» — со значением небрежности, халатности, неаккуратности. Если основа восходит к нему, то прозвище Кистайка носило иронический оттенок и подчёркивало определённую черту характера или привычку человека.

Из двух гипотез первая — «дорожная» — выглядит убедительнее, поскольку напрямую связывает имя с мокшанской лексикой и традицией имянаречения. Вторая, диалектная, возможна, но менее типична для мордовской ономастики, где фамилии чаще образуются от имён, а не от бытовых прозвищ с отрицательной окраской.

Фамилия Кистайкины — не просто родовое имя, а памятник мордовской письменности и культуры. Она сохранила слово, которое в бытовой речи уже почти не встречается, и напоминает о том, как называли детей по приметам пути.