Скорее всего, фамилия Кистер образована от прозвища, которое восходит к немецкому слову Küster - «церковный сторож», «пономарь», «могильщик», «ризничий». Таким образом, она содержит указание на род занятий предка. Менее вероятно, что в основе этой фамилии лежит уменьшительная форма имени Кристиан — Кист или Кирст. Например, только у евреев можно было встретить такие фамилии, как Вейценбаум, что в переводе с немецкого означало «пшеничное дерево», Зауэрштром – «кислый поток», Левенфиш – «рыба-лев», Цигенбаум – «козье дерево», Квечман – «высказываться неохотно».