Фамилия Киструсский — редкий случай, когда географическая основа почти наверняка перевешивает любую другую версию. Суффикс -ский прямо указывает на дворянский или шляхетский способ образования: так называли владельцев поместий, выходцев из конкретного села или местечка. В русской традиции фамилии на -ский долго оставались маркером социального статуса, хотя к XIX веку их могли носить и духовенство, и мещане.

Корень «Киструс» не имеет очевидных славянских, тюркских или финно-угорских параллелей в антропонимике. Это почти наверняка топоним — название населённого пункта. На картах XIX века встречается местечко Киструс (вариант: Киструсь) в Могилёвской губернии, на территории современной Беларуси. Именно от этого села и могли получить прозвание местные помещики или шляхтичи. Фамилия могла закрепиться за теми, кто владел землёй в Киструсе или переселился оттуда в другую губернию.

Менее вероятна, но возможна версия от прозвища, образованного от диалектного слова. В некоторых говорах «киструс» могло означать нечто вроде «кистень» или «вислый предмет» (ср. с «кисть»), но подтверждений этому в ономастических словарях нет. Без письменных источников такую гипотезу считать основной рискованно.

В польской ономастике фамилии с суффиксом -ski от названий на -us встречаются, хотя и нечасто. Если род Киструсских имел польские корни, то фамилия могла быть образована от названия фольварка или урочища. В любом случае, географическая привязка к конкретному пункту — самый надёжный путь для генеалогического поиска. Носителям фамилии стоит искать предков в восточных воеводствах Речи Посполитой, особенно в окрестностях Могилёва.

Фамилия крайне редкая, в современных справочниках массово не фиксируется. Это значит, что большинство её носителей, скорее всего, восходят к одному роду или к нескольким ветвям, разошедшимся из одного гнезда.