Фамилия Клавдина — редкий случай, когда за основу взято не просто имя, а его видоизменённая, народная форма. В официальных документах и метриках имя Клавдия (женская форма от римского родового имени Claudius) записывали целиком, но в быту, в деревнях и слободах, его сокращали. Так появилось имя Клавда — уменьшительное, разговорное. От него и пошла фамилия: суффикс -ин указывает на принадлежность — «чей?» — «Клавдин», то есть сын или потомок Клавды. Модель образования здесь та же, что у фамилий Марьин, Дарьин, Натальин, но с той разницей, что женское имя дало основу не так часто, как мужское.

Споров вокруг корня почти нет. Версия о происхождении от редкого мужского имени Клавд (гипотетической народной формы от Клавдий) выглядит слабее: в документах XVII–XVIII веков такая форма почти не встречается, а вот женское Клавда фиксируется в переписных книгах, особенно в центральных и южных губерниях. Правдоподобнее считать, что фамилию дали по матери или бабушке — в тех случаях, когда женщина оставалась главой семьи или когда ребёнок рос без отца. В крестьянской среде это случалось часто, и фамилии по женским именам (Ульянин, Акулин, Марьин) не редкость.

Географически Клавдины тяготеют к Поволжью и югу России. В дореволюционных списках фамилия встречается в Тамбовской, Саратовской и Воронежской губерниях — там, где имя Клавдия было особенно популярно среди простых сословий. В дворянской среде эта фамилия не зафиксирована: знатные роды предпочитали полные формы имени и суффикс -ов (Клавдиев), а не просторечный -ин.

По сути, Клавдина — фамилия-память о женщине, которую в семье звали Клавдой. Никакого ремесла, прозвища или географического названия за ней не стоит. Только имя, которое прошло через народное произношение и закрепилось в документах как родовое.