Фамилия Клепакова, как и большинство русских фамилий, хранит в себе память о занятиях и прозвищах предков. В её основе — прозвище Клепак, которое напрямую связано с глаголом «клепать». На языке мастеров это означало соединять или скреплять металлические части холодной ковкой: расплющить конец гвоздя или загнуть край листа. Поэтому Клепаком в народе называли кузнеца, жестянщика или любого ремесленника, работавшего с металлом. Прозвище оказалось настолько цепким, что закрепилось за человеком как основное именование, а затем перешло в фамилию — сначала Клепаков, а в женском роде — Клепакова.

Словообразовательная модель здесь классическая: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?»), то есть Клепаков — это сын Клепака. Фамилия относится к патронимическому типу, но с профессиональной, а не лично-именной основой. В отличие, скажем, от фамилий на -ин (типа Пушкин), здесь нет указания на мать или жену, только на отца-ремесленника.

Документальные следы фамилии встречаются в Памятных книгах. В Книге памяти Томской области упомянута Аграфена Васильевна Клепакова, родившаяся в 1895 году. А в документах Харьковской губернии сохранилась запись о Денисе Петровиче Клепакове, 1876 года рождения, из села Борово Кулянского уезда. Эти записи — не просто имена, а точки привязки: они показывают, что к концу XIX века фамилия уже прочно бытовала и в Сибири, и на юге России, что говорит о широком расселении носителей.

Интересно, что фамилия Клепакова не имеет варианта с суффиксом -ин, хотя «клепак» — слово мужского рода на согласный. Это ещё раз подтверждает, что модель на -ов/-ев была основной для прозвищ, оканчивающихся на твёрдый согласный. В говорах могло встречаться и ударение на последнем слоге — Клепако́в, но литературная норма закрепила форму Клепа́ков.