Фамилия Клепаков образована от прозвища Клепак. Оно берет начало от глагола «клепать», то есть «соединять или скреплять металлические вещи холодною ковкой, пропустя гвоздь и расплющив концы его, или загибая листы край в край». Вероятно, именование Клепак относится к профессиональным и указывает на род занятий его обладателя. Так могли назвать того, кто занимался изготовлением и ремонтом металлических изделий. Так и прозвище Клепак закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Клепаков. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Клепак, со временем получил фамилию Клепаков. Так, например, в Книге памяти Томской области упоминается Аграфена Васильевна Клепакова, родившаяся в 1895 году. Также в документах содержится информация о Денисе Петровиче Клепакове, родившемся в 1876 году в селе Борово Кулянского уезда Харьковской губернии.