Фамилия Клепинин — это классическое русское отчество, построенное по цепочке: в её основе лежит прозвище Клепа, от него образовано отчество первой степени Клепин («чей?» — сын Клепы), а затем уже от него — отчество второй степени Клепинин («чей?» — внук Клепы, потомок Клепина). Такая трёхступенчатая модель (прозвище → отчество на -ин → фамилия на -ин) характерна для фамилий, которые окончательно закрепились в XVI–XVII веках, когда на смену краткой форме «Клепин» пришла полная форма с двойным суффиксом.

Что означало само прозвище Клепа? Тут есть два основных пути, и оба связаны с глаголом «клепать». Первое, самое прямое значение глагола — скреплять металлические детали холодной ковкой, то есть работать клепальщиком. Второе, переносное, диалектное — клеветать, наговаривать, взводить напраслину. Соответственно, прозвище Клепа могли дать либо человеку по профессии (кузнецу-клепальщику), либо, реже, тому, кто отличался недобрым языком и любовью к сплетням.

Есть, однако, и третий, менее очевидный вариант, который не стоит сбрасывать со счетов. В русских говорах слово «клепа» (или «клёпа») могло обозначать пушного зверька, например, куницу или соболя — так называли добычу охотников-пушников. В этом случае прозвище указывало бы на занятие предка: он мог быть охотником или торговцем пушниной. Прямых лингвистических подтверждений у этой версии меньше, чем у «кузнечной», но в контексте северных и сибирских регионов, где пушной промысел был основой хозяйства, она вполне правдоподобна.

Таким образом, фамилия Клепинин не имеет однозначного толкования, но все версии сходятся в одном: её носители происходят от человека, которого в быту называли по его ремеслу или характерной черте. Спор между «клепальщиком» и «пушником» остаётся открытым, но первая версия, подкреплённая общеславянской лексикой, выглядит более надёжной. Географически фамилия встречается рассеянно, без резкой привязки к одному региону, что говорит о её раннем и достаточно широком распространении среди крестьян и посадских людей.