Фамилия Клепцин — редкий пример того, как прозвище, образованное с помощью уменьшительного суффикса -ц-, превратилось в фамилию на -ин. В основе лежит прозвище Клепца. Такая модель (Клепца → Клепцин) типична для северных и центральных областей России, где фамилии на -ин часто образовывали от прозвищ и имён, оканчивающихся на -а.

Что означало слово «клепца» — вопрос открытый. Самая прямая версия: так называли небольшой капкан на куницу, лису или зайца. Охотничье прозвище, указывающее либо на занятие, либо на хитрость и цепкость человека — «хваткий, как капкан».

Но есть и вторая, более «ремесленная» версия. Глагол «клепать» (скреплять металл холодной ковкой, расплющивая заклёпку) дал множество прозвищ мастерам. Клепца — тот, кто клепает: кузнец по металлической мелочи, изготовитель заклёпок, лудильщик. Оба значения — охотничье и кузнечное — одинаково правдоподобны, и выбрать одно без точного знания о месте происхождения фамилии невозможно. В любом случае, прозвище Клепца было профессиональным или характеризовало человека по действию, а суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: «сын Клепцы».