Мужское крестильное имя Климент в переводе с греческого языка означает «милостливый», по другой версии - «виноградная лоза». В основу фамилии легла производная форма имени — Клим. Скорее всего, основатель рода Климниковых был выходцем из рабочей или крестьянской среды. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Клим, со временем получил фамилию Климников.