Фамилия Климпота — редкий случай, когда написание почти не оставляет сомнений в происхождении. Основа здесь — не русское и не славянское слово, а румынское (молдавское) climpotă или climpoi, что значит «волынка». Это не имя и не профессия в привычном понимании, а прозвище: волынщиком, музыкантом, играющим на народном инструменте, могли назвать человека, который либо сам играл, либо постоянно ходил с волынкой, либо чем-то напоминал её — например, был шумным или имел округлую фигуру.

Суффикс -а в фамилии Климпота указывает на то, что это не отчество, а застывшая форма прозвища или имени. В молдавской и украинской традиции такие фамилии на -а, -я (Климпота, Скрипка, Кобза) часто передавались без дополнительных русских суффиксов -ов или -ин. Это говорит о том, что носители фамилии, скорее всего, происходят из регионов, где соприкасались молдавский, украинский и русский языки: из Бессарабии, Подолья, Буковины или юга Одесской области.

Версия, что Климпота — это искажённое «Клим Пота» (то есть Клим, сын Пота), маловероятна. Такое стяжение нехарактерно для восточнославянской антропонимии: двойные имена обычно давались в форме «Клим Потапович» или «Климпотап», но не «Климпота». Более того, румынское слово climpoi («волынка») встречается и в фамилиях Климпоц, Климпак, что подтверждает именно прозвищную природу.

Социально предки-Климпота могли быть свободными крестьянами или казаками, поскольку прозвища, связанные с музыкой, редко давали крепостным — скорее, так выделяли человека в общине, а не фиксировали его зависимое положение. Фамилия не дворянская и не купеческая: в старых списках служилых людей она не встречается, а её ареал — юго-западные губернии Российской империи.

Сегодня Климпота остаётся редкой фамилией. Её носители живут в России, Украине и Молдове, но численно невелики. Встречаются варианты написания с двумя «т» (Климпотта) — это следствие ошибок в паспортных столах или попытки подчеркнуть ударение на последний слог.