Фамилия Клипакова — женская форма от Клипаков, и её разбор стоит начать с суффикса. Модель на -ов/-ев указывает на принадлежность: основа фамилии — прозвище или мирское имя Клипак. Это типичная для русских фамилий схема, где суффикс означает «сын такого-то» или «из семьи такого-то».

Корень «клип-» неочевиден. Вероятнее всего, он связан с диалектным словом «клипа» — так в некоторых говорах называли клюку, палку с загнутым концом, или кочергу. Прозвище Клипак могли дать человеку с характерной походкой (опирающемуся на палку), либо тому, кто изготавливал такие предметы — например, кузнецу или плотнику, делавшему кочерги и ухваты. Менее вероятна, но возможна связь с глаголом «клипать» (хромать, припадать на ногу) — тогда прозвище описывало физическую особенность.

В ономастических справочниках фамилия Клипаков встречается редко, что делает её интересной для региональной истории. Судя по географии, она бытует преимущественно в центральных и южнорусских областях, где сохранялась диалектная лексика. Сословная принадлежность предков, скорее всего, крестьянская или ремесленная: в дворянских родословных книгах такая фамилия не фиксируется.

Примечательна и параллель с другими фамилиями того же корня: Клипов, Клипко, Клипкин. Все они восходят к той же основе, но с разными суффиксами, что говорит о самостоятельном, а не производном происхождении. Клипаков — не искажение более известной фамилии, а самостоятельная модель, закрепившаяся в конкретном роду.