Фамилия Клишо не укладывается в привычную схему «сын такого-то», как, скажем, Иваненко. Её основа и суффикс заставляют искать ответ не в отчестве, а в прозвище или профессии. Словообразовательная модель здесь необычна: суффикс -о встречается в русских фамилиях редко, чаще он характерен для украинских (Клименко, Шевченко) или белорусских окончаний. Но Клишо — это не типичное -енко. Фамилия явно западного или южного происхождения, вероятно, из регионов, где польское или украинское влияние смешивалось с русским.

Корень «Клиш-» можно вывести из нескольких источников. Первый и самый прямой — прозвище от слова «клиш» или «клиша», которое в диалектах означало кривоногого человека, того, кто ходит вразвалку или косолапит. В русских говорах известно слово «клиша» — нога, вывернутая наружу, отсюда и «клишоногий». Второй вариант — польское «klisz» или украинское «кліш», что может быть связано с формой чего-то согнутого, изогнутого, например, клешни рака (сравните с польским «kliszcz» — клешня). В этом случае прозвище могли дать человеку с цепкими руками, кузнецу или тому, кто работал с изогнутыми инструментами.

Третья, менее очевидная версия — связь с личным именем Климент (Клим). В некоторых говорах уменьшительная форма могла звучать как Клиш, а суффикс -о добавлял просторечный или ласкательный оттенок. Однако эта гипотеза слабее: для имени Клим более привычны фамилии Климов, Клименко, а Клишо — слишком редкая форма, чтобы считать её основной.

География фамилии подсказывает, что её носители концентрируются на западе бывшей Российской империи: в Беларуси, на Украине и в прилегающих областях России, вплоть до Смоленщины и Брянщины. Это подтверждает версию о прозвищном происхождении — такие фамилии часто возникали в крестьянской среде, где внешность или особенность походки давали стойкое «уличное» имя, которое потом закреплялось за родом. Сословно это, скорее всего, крестьяне или мещане: дворянские фамилии с таким корнем и суффиксом не фиксируются.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Клишо стоит рядом с Клишов, Клишев, Клищенко. Но суффикс -о делает её уникальной: он указывает на то, что фамилия могла застыть в форме прозвища без патронимического окончания. Такое встречается, когда прозвище настолько прирастало к человеку, что становилось фамилией в исходном виде, без добавления -ов или -ин. Например, в украинской традиции есть фамилии типа Голова, Кривоніс, а Клишо — тот же случай, только с корнем, описывающим физический недостаток.

Таким образом, наиболее правдоподобное объяснение: фамилия Клишо происходит от прозвища, данного человеку с характерной походкой (клишоногого) или с руками, напоминающими клешни. Это не «сын» и не «внук», а прямое описание предка, которое сохранилось в неизменной форме.