Фамилия Клочаний — редкая и, на первый взгляд, неочевидная по происхождению. Её главная особенность — суффикс -ий, который в русских фамилиях встречается нечасто и почти всегда указывает на польское или украинское влияние. Если бы фамилия была русской, она скорее звучала бы как Клочанов или Клочанин. Форма на -ий (Клочаний) характерна для фамилий, образованных от прилагательных, и часто встречается у украинцев, белорусов и поляков, а также у потомков выходцев из этих земель в России.

Основа фамилии — «клоча» или «клоч». В русских говорах «клоч» — это клок, обрывок, пучок (шерсти, сена, волос). Прозвище Клоч или Клоча могли дать человеку за неопрятный, взлохмаченный вид, за торчащие в разные стороны волосы или за растрёпанную одежду. В украинском языке «клоччя» — это пакля, очёски льна или конопли, то есть грубое, спутанное волокно. Соответственно, прозвище могло относиться к тому, кто занимался обработкой льна или просто имел дело с паклей — возможно, конопатчик или шпагатник.

Есть и менее очевидная, но правдоподобная версия: фамилия могла возникнуть от топонима — названия села или хутора вроде Клочи, Клочаны. Такие названия есть в западных областях Украины и Беларуси. Тогда Клочаний — это указание на выходца из этого места («из Клочей»), что для польско-украинской ономастики типично: суффикс -ий часто передаёт принадлежность к местности.

Таким образом, перед нами фамилия, скорее всего, украинского или белорусского корня, прозвищная по происхождению. Предок носителя фамилии мог быть либо небрежным в одежде человеком, либо работником, связанным с пенькой и паклей, либо жителем села с похожим названием. В написании важно не путать её с более частыми Клочановыми — суффикс -ий здесь ключевой маркер происхождения.