Фамилия Клопотной образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Фамилия Клопотной восходит к слову «хлопотный». Хлопотным называли суетливого, беспокойного или сварливого человека, возможно, заботливого, старательного. Изменение начального звука «х» на «к», возможно, объясняется влиянием диалектного произношения. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Клопотной, со временем получил фамилию Клопотной. О точном месте и времени возникновения фамилии Клопотной в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Клопотной представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.