Прозвище Клопот восходит к украинскому слову «клопотати» - «тревожить». Вероятно, так называли суетливого, беспокойного или сварливого человека, возможно, заботливого, старательного. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Клопот, со временем получил фамилию Клопотов.