Фамилия Княгин происходит не от титула «князь», как можно подумать, а от женского имени или прозвища Княгиня. В русской традиции притяжательные фамилии на -ин образовывались от основ, оканчивающихся на -а или -я: Княгиня → Княгин, то есть «сын Княгини». Так могли назвать сына женщины, которую в деревне или в семье звали Княгиней — либо в шутку, либо за её гордую осанку, властный характер, либо потому, что она действительно была женой князя или происходила из княжеского рода. В крестьянской среде прозвище часто давали иронично: «княгиней» могли окрестить женщину, которая держалась с достоинством или любила наряжаться.

Вторая, менее вероятная, версия связывает фамилию с топонимом: селения с названием Княгино или Княгинино встречаются в центральной России, и выходец оттуда мог получить фамилию Княгин. Однако для такой модели типичен суффикс -ский (Княгинский), поэтому первая версия выглядит убедительнее.

В фамилии нет суффикса -ов, что указывает на её более древний пласт: фамилии на -ин в русском языке старше и часто восходят к прозвищам или именам, а не к географическим названиям. По сословной принадлежности Княгины могли быть как крестьянами, так и мещанами или духовенством — в среде священников тоже давали прозвища по женским именам.

Встречается фамилия преимущественно в центральных и северных областях России, а также в Поволжье. В дореволюционных записях Княгины фигурируют среди крестьян Ярославской, Костромской и Вологодской губерний. Известных носителей фамилии в истории немного, и они не составили громких династий — фамилия осталась редкой, локальной, что подтверждает её бытовое, а не аристократическое происхождение.