Фамилия Княгина — отчество от прозвища, а не от титула. Вопреки ожиданиям, она не указывает на родство с княжеской женой, а образована от личного имени или прозвища Княгиня. Такое имя в старину давали не только дочери или жене князя, но и крестьянскому ребёнку — по народной традиции «именовать по-княжески» для защиты от сглаза или в шутку. В крестьянской среде прозвище Княгиня могла получить и женщина с властным, величавым нравом, либо та, что носила дорогую одежду или выделялась статью.

Модель образования проста: суффикс -ин указывает на принадлежность. Княгина — «дочь или жена Княгини». В русской ономастике фамилии на -ин типичны для северных и центральных областей, где активно использовали женские прозвища как основу для фамилий. Если бы фамилия была образована от мужского имени Князь, мы бы имели Князев, а не Княгин. Поэтому версия с женским корнем — основная и подтверждается данными переписей: в документах XVII века встречаются крестьяне Княгинины, что закрепляет женскую основу.

Географически фамилия редкая, встречается преимущественно в Вологодской, Архангельской и Костромской областях — регионах, где фамилии на -ин исторически преобладали над -ов. Встречаются и варианты написания: Княгинин, но Княгина — более краткая и древняя форма.

Однокоренные фамилии — Князев, Князьков, Княжин — имеют разное происхождение. Князев прямо указывает на отчество от мужского имени Князь, а Княгина стоит особняком как редкий случай женской основы в фамилии, что делает её интересным объектом для этимолога.