Фамилия Кобрын — редкий случай, когда географическое название почти наверняка перевесило личное прозвище. В отличие от распространённых Кобриных, которые происходят от прозвища Кобра (от змеи или, реже, от диалектного «кобёр» — мешок, кулёк), форма Кобрын с твёрдым «ы» указывает на иную модель. Скорее всего, перед нами усечённый вариант от названия города Кобрин (ныне Брестская область, Беларусь). В старых документах выходцев оттуда могли записывать как Кобрынец или Кобринский, но в просторечии фамилия легко урезалась до однословной — Кобрын. Суффикс «-ын» здесь не притяжательный (как в фамилиях на «-ин» от имён на «-а»), а оформительский, характерный для прозвищ и отыменных фамилий западных регионов.

Вторая, менее вероятная, но лингвистически возможная версия — связь с диалектным словом «кобрынка» (вид плетёной корзины или рыболовной снасти). В этом случае фамилия могла возникнуть как прозвище корзинщика или рыбака, но такая основа не фиксируется в ономастических словарях как продуктивная. Поскольку фамилия встречается редко и не образует гнезда однокоренных (нет массовых Кобрынских, Кобрынцевых), версия с топонимом выглядит убедительнее.

Социальный состав носителей, судя по архивным данным XIX века, — крестьяне и мещане западных губерний (Гродненской, Минской), что тоже подтверждает связь с регионом Кобрина. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. В современной России фамилия рассеяна, но не частотна: по переписям, её носителей — единицы на регион, что говорит о сохранении локальных корней.