Фамилия Кочктов — редкий случай, когда написание почти полностью скрывает исходное слово. На первый взгляд она кажется производной от «кочка» или «кочет», но суффикс -ов указывает на притяжательное значение: чей? — Кочктов. Основа «кочкт» в русском языке не встречается. Скорее всего, перед нами результат искажения, которое могло возникнуть при записи фамилии в документах или при переходе из устной речи в письменную.

Самая вероятная версия: фамилия восходит к прозвищу Кочеток (уменьшительное от «кочет» — петух). В диалектах южнорусских и украинских областей «кочет» — распространённое слово, а фамилии Кочетов, Кочетков встречаются часто. Здесь же произошла потеря гласной в корне: Кочетков мог превратиться в Кочктков, а затем упроститься до Кочктов. Такая редукция характерна для «живой» речи, где слово «кочеток» произносят как «кочток», отсюда и фамилия Кочктов — «сын того, кого звали Кочеток».

Менее вероятная, но допустимая гипотеза — связь с диалектным словом «кочка» (неровность на болоте, а также в переносном смысле — невысокий, коренастый человек). Однако суффикс -ов в сочетании с основой «кочк-» дал бы фамилию Кочков, а не Кочктов. Поэтому появление лишней согласной «т» объяснить сложнее, чем потерю гласной в «кочеток».

Фамилия очень редкая. В открытых базах данных она практически не встречается, что говорит о её локальном бытовании, возможно, в одной из южнорусских губерний или среди переселенцев. Носители фамилии Кочктов, скорее всего, потомки человека, которого в деревне прозвали Кочетком — за бойкий нрав, громкий голос или любовь к петушиным боям. Фамилия не дворянская и не купеческая, а крестьянская или мещанская, что типично для прозвищных образований.