Фамилия Когот — редкий случай, когда прозвище перешло в фамилию почти без изменений, без типичных суффиксов -ов, -ин или -ский. Это так называемая «окаменевшая» форма: сам корень стал фамилией. Основа — «коготь», но в старой орфографии и говорах слово нередко писалось и произносилось через «о»: «когот». Именно так, в именительном падеже единственного числа, закрепилась фамилия. Такая модель встречается у прозвищ, данных по внешности, повадкам или профессии.

Скорее всего, прозвище Когот дали человеку с цепкими, длинными пальцами или с особой хваткой — например, мастеру, который крепко держал инструмент, или драчуну, который вцеплялся в противника. В говорах слово «коготь» могло означать и крюк, и загнутый конец какого-либо орудия, так что не исключено, что предок был кузнецом или плотником, делавшим такие детали. Вторая, менее очевидная версия: прозвище могло быть связано с птицей — «когтистый» как «хищный», «зоркий». Но это предположение слабее, потому что прямое указание на часть тела или инструмент встречается в русских прозвищах чаще, чем зооморфные сравнения.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и украинским областям, где «аканье» не было распространено, и «о» в корне сохранялось устойчиво. Встречается она редко, в основном в единичных записях XIX–XX веков. Суффиксальные варианты вроде Когтев или Коготков куда многочисленнее, и Когот на их фоне — архаичная, «прямая» форма, которая не успела обрасти стандартным окончанием или, напротив, сохранилась как пережиток старой традиции именовать человека одним словом.

В словарях Б. Унбегауна и В. Никонова эта фамилия отдельно не разбирается, но по аналогии с фамилиями типа Ноготь, Локоть, Коготь (с тем же корнем) она относится к группе прозвищных именований, образованных от названий частей тела. Сословной привязки нет: так могли прозвать и крестьянина, и ремесленника, и служилого человека. Единственное, что можно сказать уверенно: фамилия не искусственная, не семинарская и не дворянская — она выросла из живого обихода.