Фамилия Кокшарева — женская форма фамилии Кокшарев, которая в свою очередь образована от прозвища или нецерковного имени Кокшарь. Основа «кокш-» в русских говорах имеет несколько значений, и чтобы понять, кем мог быть предок, нужно разобраться в географии и диалектах.

Самый прямой путь — от слова «кокша». В вятских и пермских говорах так называли человека с кудрявыми, всклокоченными волосами, а также птицу — дрозда или сойку. Прозвище Кокша (или Кокшарь) могли дать за внешность — за вихры или за то, что человек, как птица, суетлив и криклив. Суффикс -арь в фамилии Кокшарев указывает на деятеля: Кокшарь — это тот, кто имеет отношение к кокше (либо сам носитель такого прозвища, либо, что реже, человек, занимающийся ловлей кокш — птиц).

Есть и другая, менее очевидная версия. В древнерусских документах встречается слово «кокшарь» в значении «пирожник» или «тот, кто печёт кокши» — особый вид хлеба или пирогов. В этом случае предок был пекарем или торговцем выпечкой. Версия с птицей или внешностью кажется более распространённой, так как прозвища по внешнему виду давали чаще, чем по узкому ремеслу.

Фамилия Кокшарев (и Кокшарева) — относительно редкая, но с чёткой географической привязкой: она встречается в основном в Поволжье и на Урале, особенно в Кировской области (бывшая Вятская губерния) и в Пермском крае. Это совпадает с ареалом слова «кокша» в значении «вихры» или «сойка». Примечательно, что в тех же местах бытует фамилия Кокшаров — она образована от той же основы, но с другим суффиксом (-ов вместо -ев), что говорит о региональных различиях в оформлении фамилий: в одном селе могли записать Кокшаров, в соседнем — Кокшарев, хотя корень один.

Модель образования типична для русских фамилий: основа (прозвище Кокшарь) плюс притяжательный суффикс -ев (отвечает на вопрос «чей?»). То есть Кокшарев — сын Кокшаря. Первые носители фамилии, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми, получившими фамилию по прозвищу отца в конце XVII — первой половине XIX века, когда фамилии массово закреплялись за податными сословиями.