Основой фамилии Кокушкин послужило мирское имя Кокушка. Мирское имя Кокушка восходит к аналогичному нарицательному. Это слово употреблялось в литературе XVIII века вместо «кукушка». Сумарокова есть притча «Кокушка», начинающаяся стихами: «Грач вырвался из рук, из города домой. Кокушка говорит: «Скажи, дружочек мой, Как в городе молва о песнях наших?» Мирские имена, происходящие от названий птиц, были часты в деревнях, и от них образовалось немало «птичьих» фамилий. Давая младенцу такое имя, как Кокушка, родители хотели, чтобы природа воспринимала ребенка как своего, чтобы к нему перешли те полезные качества, которыми наделен избранный представитель животного мира. Ее крик воспринимался как предзнаменование важных событий в жизни человека: несчастье, замужество, слезы, болезнь, пожар, смерть и даже подорожание товаров. Кукушке отводилась роль посредника между миром живых и мертвых. Нередко слово «кокушка» используется как ласковое обращение к женщине. Однако не следует исключать возможность того, что в основу фамилии Кокушкин легло прозвище Кокушка, данное вдове или нерадивой матери, покинувшей своих детей. Известно, что некоторые Кокушкины - нетитулованное российское дворянство, которое произошло от Василия Кокушкина. Семейный герб Кокушкиных помещен в первую часть «Общего гербовника Дворянских родов Всероссийской Империи». В исторических документах также упоминается иваново-вознесенская династия текстильных фабрикантов Кокушкиных. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Кокушка, со временем получил фамилию Кокушкин.