Фамилия Колбушкин — из числа тех, где разбор начинается не с корня, а с суффикса. Двойной суффикс «-ушк-» в основе встречается нечасто: это не уменьшительная форма от имени (как в Ванюшкин), а суффикс прозвища, который мог указывать на внешность, повадку или занятие. Сравните: Голубушкин, Моргушкин, Прыгушкин — все они образованы от глагольных или описательных прозвищ.

Основа «колб-» ведет к двум правдоподобным версиям. Первая — от слова «колба»: стеклянный сосуд, лабораторный инструмент. В говорах так могли назвать мастера-стеклодува, аптекаря или человека, который торговал посудой. Вторая версия — от диалектного «колбать» (качать, шатать, болтать). В северных и сибирских говорах «колбушка» — это болтун, пустомеля, а то и просто неуклюжий человек, который ходит вразвалку. Прозвище Колбушка, скорее всего, относилось к такому человеку, а суффикс «-ин» добавил значение «чей сын»: Колбушкин — сын Колбушки.

Географически фамилия редкая, но встречается в Поволжье и на Урале — в тех краях, где активно бытовали прозвищные формы на «-ушка». В документах XVII–XVIII веков попадаются крестьяне и посадские люди с прозвищем Колба, Колбушка — это подтверждает, что основа не книжная, а народная.

Если сравнивать с однокоренными, то Колбушкин стоит особняком от фамилий вроде Колбин (от имени Колба, производного от Николая) или Колбасов (от еды). У Колбушкина нет очевидной связи с календарным именем — это чисто прозвищная фамилия, и её носитель вряд ли был дворянином или духовным лицом. Скорее всего, предок — ремесленник или крестьянин, получивший уличное прозвище за характер или занятие.