Фамилия Колупанко — один из тех случаев, когда прозвище прочно закрепилось в качестве родового имени. В её основе лежит древнерусское слово «колупать», то есть «ковырять, крошить, отдирать». Обычно такое прозвище давали человеку с неспешной или неаккуратной манерой есть — тому, кто «ковыряется» в тарелке. Однако есть и другая, менее очевидная версия: в южнорусских говорах «колупа» означала человека хмурого, вялого, медлительного. В этом случае прозвище характеризовало не манеру поведения за столом, а общий склад характера.

Сама фамилия образована по распространённой на Украине и в южных областях России модели: к основе Колупан- добавился типичный украинский суффикс -ко. Такие фамилии (на -енко, -анко, -упанко) первоначально означали «сын» или «потомок того, кого звали Колупан». То есть Колупанко — это буквально «Колупанов сын» или «маленький Колупан».

С точки зрения словообразования фамилия интересна тем, что сохранила редкий суффикс -ан-, который в русских прозвищах часто указывал на носителя действия или признака. Колупан — тот, кто колупает, или тот, кто сам «колупа» (хмурый). В отличие от более частых фамилий на -ов/-ев, модель с -анко не стала общеупотребительной за пределами Украины, поэтому Колупанко — яркий маркер южнорусского или украинского происхождения рода.

Писали фамилию по-разному: в дореволюционных метриках можно встретить варианты Колупанко, Колупанков, а иногда и Колупанченко — всё зависит от местного говора и грамотности писаря. Но именно форма на -ко закрепилась как основная.

Что касается социального контекста: носители фамилии Колупанко в большинстве своём были крестьянами или мещанами. Прозвища, связанные с бытовыми действиями или чертами характера, редко давали дворянам — те чаще получали фамилии от названий имений или по отчеству. Так что предки современных Колупанко, скорее всего, были людьми простого сословия, и фамилия сохранила для нас живое слово из народной речи.