Фамилия Колыпина — женская форма фамилии Колыпин, которая принадлежит к сравнительно редкому типу русских фамилий с суффиксом -ин. Этот суффикс указывает на принадлежность: Колыпин буквально означало «сын Колыпы» или «человек из семьи Колыпы». Основа фамилии — прозвище или неканоническое имя Колыпа.

Корень «колып-» не имеет очевидных параллелей в современном русском литературном языке. Самая вероятная версия связывает его с диалектным словом «колыпь» — так в некоторых говорах называли короткий, толстый обрубок бревна, чурбан. Если это так, то прозвище Колыпа могли дать человеку невысокого роста, коренастому, плотному. В старину такие бытовые прозвища по внешности были обычны: Бревно, Пень, Чурка, Колода — и Колыпа стоит в этом же ряду.

Другая версия, менее распространённая, возводит основу к тюркским языкам. В некоторых тюркских наречиях «колып» означает «оставаться», «задерживаться». В таком случае прозвище могло закрепиться за медлительным или нерасторопным человеком. Однако эта гипотеза слабее: для тюркских заимствований в русских фамилиях чаще характерны основы, связанные с титулами, животными или конкретными предметами, а не с глаголами.

Фамилия Колыпин (и Колыпина) встречается в основном в центральных и северных областях России, особенно в Вологодской и Архангельской губерниях. Это косвенно подтверждает первую версию: именно в северных говорах слово «колыпь» было употребительно. Носители фамилии, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми, а фамилия закрепилась за их потомками как родовая в XVI–XVII веках, когда у русских крестьян начали массово появляться фамилии на -ов и -ин.

Интересная деталь: фамилия Колыпин не имеет однокоренных «братьев» вроде Колыпов или Колыпский, что говорит о локальном, а не общерусском происхождении. Это не фамилия, разошедшаяся по всей стране, а местное прозвище, которое застыло в документах одной-двух волостей. Поэтому, встречая сегодня фамилию Колыпина, с большой вероятностью можно предполагать, что её корни уходят именно в Русский Север.