Фамилия Колыженкова — женская форма фамилии Колыженков, а та, в свою очередь, образована от мужского прозвища или имени Колыженок. Чтобы понять её корни, стоит разобрать модель: суффикс -енк- здесь не уменьшительный (как в «котёнок»), а патронимический, характерный для восточноукраинских и южнорусских земель. В отличие от великорусского -ов/-ев или -ин, фамилии на -енко (и их производные на -ков, -кин) в XVII–XVIII веках активно формировались на Слобожанщине, в Черниговской, Полтавской губерниях и в приграничных областях России. Поэтому первая версия: предок носительницы фамилии — выходец с Украины или из южных уездов России.

Основа Колыжен- может восходить к двум разным источникам. Первый и самый вероятный — прозвище Колыга или Колыжка. В русских говорах «колыга» — это не только небольшая колючка или шишка, но и прозвище невысокого, коренастого человека (от диалектного «колыга» — коротышка). Второй вариант — связь с глаголом «колыхать»: Колыженком могли называть ребёнка, которого часто качали, или взрослого с плавной, «колышащейся» походкой. В ономастике известна фамилия Колыгин (по В. Никонову, от прозвища Колыга), и Колыженков — её редкий патронимический вариант с южнорусским суффиксом.

Ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог: Колы́женкова, хотя в некоторых говорах возможно Колыженко́ва — это зависит от местной традиции произношения. Социальный состав носителей фамилии типичен для крестьянских и казачьих родов: Колыженковы встречаются в метрических книгах Курской и Воронежской губерний XIX века, что подтверждает версию о южном происхождении. В отличие от фамилий на -ский, которые часто указывали на дворянское или духовное сословие, модель на -енко оставалась простонародной.

Фамилия редкая: в современных справочниках она не фигурирует среди частых, что делает её ценной для локальной генеалогии. Если искать однокоренные, то стоит обратить внимание на Колыгин, Колыгаев, Колыханов — все они расходятся по разным суффиксальным моделям от одной основы. Таким образом, Колыженкова — это фамилия-указатель на южнорусский или украинский корень, связанная с прозвищем по внешности или походке, и её носительницы могут с высокой вероятностью проследить родословную до чернозёмных губерний или Слобожанщины.