Фамилия Командик — редкий пример, где прозвище, скорее всего, образовано напрямую от военного чина «командир», но с уменьшительным суффиксом -ик. Суффикс этот в русских фамилиях встречается нечасто. Чаще он указывает на принадлежность к чему-то или на прозвище по характерному признаку, но здесь он придаёт слову оттенок бытовой или ироничный: Командик — это не столько большой начальник, сколько человек, который «командует» в малом кругу.

В основе лежит слово «командир». В прямом значении так могли назвать человека, командовавшего военно-морской частью — например, на флоте или в казачьих станицах. Это прозвище попадает в разряд «профессиональных» именований: оно указывало на род занятий предка. Однако в переносном смысле «командир» — это строгий, властный человек, который любил держать всё под контролем и повелевать. В таком случае Командиком могли прозвать не по должности, а по характеру — волевого и сурового человека.

Есть и третья версия, которую поддерживают некоторые ономасты (в частности, исследователь военных фамилий В. Никонов упоминал подобные случаи). Фамилия Командик могла возникнуть искусственно, в период Первой мировой войны, когда солдатам и офицерам нередко присваивали фамилии по званиям, должностям или названиям воинских частей. Такие фамилии, как Командик, Команик, Полковников, могли даваться призванным на службу новобранцам, у которых не было родовой фамилии, или же как «благозвучные» замены.

Обратите внимание на созвучную фамилию Команик: её часто путают с Командиком, но она, скорее всего, происходит от диалектного «команик» — народного названия растения (например, ежевики или морошки). В фамилии Командик такой растительной основы нет — её корень военный, командный.