Фамилия Командина образована от прозвища Команда, а то, в свою очередь, восходит к глаголу «командовать». Прозвище могли дать по двум основным причинам. Первая — по роду занятий: Командиром называли военачальника, человека, который отдавал приказы. Вторая — по характеру: так могли прозвать того, кто любил всеми повелевать, держать под своей властью, «под рукою», даже если должность к этому не обязывала.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Командина — «жена Команды» или «дочь Команды». В русской традиции фамилии на -ин обычно возникали от основ, оканчивающихся на -а или -я. Со временем закрепилась форма женского рода, что для русских фамилий не редкость (сравните: Кузьмина, Рогозина). Таким образом, прямым предком носительницы фамилии был человек с прозвищем Команда.

Интересно, что прозвище могло закрепиться не только за самим командиром, но и за его подчинённым — как ироничное прозвание. В народной среде командирами в шутку называли бойких, властных крестьян, которые пытались указывать другим в общине. Так что фамилия Командина может хранить память как о реальном военном чине, так и о бытовом прозвище, данном за характер.

Географически фамилия встречается в центральных и южных областях России, но массового распространения не получила — это редкая форма. Обычно от той же основы образовывали фамилию Командиров, а Командина осталась локальным вариантом, закрепившимся за конкретным родом.